武功的选择直接影响战斗效率和通关体验。野球拳是游戏中最强单体攻击武功，10级后攻击力高达2000，配合左右互搏之术可秒杀任何敌人。辟邪剑法攻击力1200，伤害450，但需自宫且仅限单体攻击。九阳神功是初期最强群攻技能，攻击范围7×7，伤害270，适合清理杂兵。降龙十八掌攻击力900，伤害350，是丐帮镇派绝学，但获取难度较高。六脉神剑攻击力800，伤害300，攻击范围1×7，仅限段誉修炼。
野球拳的修炼需要极大耐心，前9级威力平庸，第10级产生质变，但需空挥600次以上才能满级。左右互搏之术是核心辅助技能，仅限资质低于45的角色学习，可让角色一回合攻击两次。九阳神功的获取需完成张无忌相关剧情，是前期快速提升战力的关键。辟邪剑法虽强，但副作用明显，需权衡是否值得牺牲角色性别。
高资质角色更适合修炼复杂武功，如独孤九剑和玄铁剑法，但无法学习左右互搏。低资质角色虽修炼速度慢，但可凭借左右互搏和野球拳实现逆袭。葵花神功是隐藏武功，攻击范围与九阳神功相当，伤害350，但需修改器调出。龙象般若功攻击力480，伤害200，特效华丽但实用性一般。
武功的威力与角色属性紧密相关，内力属性决定能否修炼特定武功，如九阳需阳派内力，辟邪需阴派内力。太玄经是石破天专属武功，攻击力700，范围7×7，但获取流程复杂。黯然销魂掌攻击力600，伤害200+，是杨过成名绝技。躺尸剑法原理与野球拳类似，10级后爆发，攻击力800，伤害300。
合理搭配武功和队友是通关关键，野球拳+左右互搏为核心输出，九阳神功辅助清场，降龙十八掌或六脉神剑补充伤害。游戏后期可挑战十大善人或十大恶人，高威力武功是取胜保障。武功秘籍的获取需完成特定剧情或击败强敌，部分隐藏武功需探索或修改器支持。
